Er stirbt am 18. Februar 1546 in Eisleben. Auf dem Sterbebett betet er:  „In Deine Hände befehle ich meinen Geist. Du hast mich erlöst, Herr, Du treuer Gott.“

Nachdem der Sarg zwei Tage in Eisleben aufgebahrt wurde, wird er nach Wittenberg überführt und am 22. Februar in der Schloßkirche zu Wittenberg beigesetzt.